CHORI-211: Zebrafish Tue (Tuebingen) strain (Danio rerio) BAC Library
CHORI-211 Tue株斑马鱼Danio rerioBAC库是由Chung Li Shu和Kazutoyo Osoegawa博士在奥克兰儿童医院研究所BACPAC资源的Pieter De Jong实验室中构建的。Gerd-Joerg Rauch博士从6名男性的睾丸中分离出基因组DNA，并用EcoRI和EcoRI甲基化酶的组合进行了部分消化。选择大小的DNA被克隆到EcoRI位点之间的pTARBAC2.1载体中。将连接产物转化入DH10B电感受态细胞（BRL LIFE TECHNOLOGIES）。该文库已被排列到384孔微量滴定皿中，并被网格划分为六个22x22cm尼龙高密度过滤器通过探针杂交进行筛选。每个杂交膜代表超过18,000个不同的斑马鱼BAC克隆，一式两份。图书馆建设得到了分包合同的支持，该分包来自Max-Planck-Institut fuer Entwicklungsbiologie的Robert Geisler博士。他的BAC库中的克隆已用作英国Sanger研究所基于克隆的测序项目以及德国Max Planx研究所的克隆指纹设计项目的一部分。可以使用“内部” Sanger命名法或“外部” NCBI推荐的命名法在各种公共数据库中找到这些克隆。例如，CH211-15B7（NCBI命名法）对应于在第15行和第7列的相交处的微量滴定皿（384孔型）＃15中发现的克隆。“内部” Sanger命名法中的同一克隆标记为：“ zC15B7”。从BACPAC资源中心（BPRC，@CHORI）订购克隆时，
bacpacresources CHORI-211说明书
Provisional data for CHORI-211 Zebrafish Tue strainDani rerioBAC Library:
Segment | 1 | 2 | All |
Vector | pTARBAC2.1 | pTARBAC2.1 | pTARBAC2.1 |
Restriction Enzyme | EcoRI/EcoRI Methylase | EcoRI/EcoRI Methylase | EcoRI/EcoRI Methylase |
DNA Source | sperm | sperm | sperm |
Plate Numbers | 1-144 | 145-288 | 1-288 |
Plate Count | 144 | 144 | 288 |
Empty Wells | 1314 (2.38%) | 1278 (2.31%) | 2592 (2.34%) |
Non-Recombinant Clones | 0 (0%) | 41 (0.08%) | 41 (0.04%) |
Non-Insert Clones | Approx. 648 (1.2%) | Approx. 1404 (2.6%) | Approx. 4104 (3.8%) |
Recombinant Clones | 53334 | 52573 | 103855 |
Average Insert Size | 171 Kbp | 160 Kbp | 165.7 Kbp |
Genomic Coverage | 5.4X | 5X | 10.4X |
组的。
CHORI-211克隆插入片段大小分布的数据已通过脉冲场凝胶电泳确定。克隆大小分布已以
本文来自投稿，不代表本人立场，如若转载，请注明出处：http://www.iamyjet.com/article/5282.html