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arcticzymes Cod UNG说明书

arcticzymesCod UNG说明书

Cod Uracil-DNA Glycosylase

鳕鱼尿嘧啶-DNA糖基化酶

来自大西洋鳕鱼的鳕鱼尿嘧啶-DNA糖基化酶(Cod UNG)是通过中度热处理*不可逆地灭活的UNG酶。该酶在含有修饰的Cod UNG基因的重组大肠杆菌(ung-)菌株中产生。

高鲁棒性

不耐热,在55°C时*不可逆转地失活

污染控制

RT-PCR,RT-qPCR,qPCR和kPCR中污染控制的理想选择

PCR后分析

启用PCR后分析

真正的不耐热尿嘧啶DNA糖基化酶

当今市场上有几种可商购的尿嘧啶-DNA糖基化酶。如果您不打算在PCR后进一步分析PCR产物,则其中大多数是细菌来源的,效果很好。但是,如果要存储PCR产物用于下游分析(例如克隆和测序),则UNG的重新激活和随后PCR产物的降解是大多数商用UNG的问题。来自ArcticZymes的Cod UNG是当今一种可*加热且不可逆地失活的UNG。

图1.*,不可逆地热灭活的UNG是Cod UNG。

如图1所示,其中测试了各种UNG在热灭活后的残留活性。用dUTP和1个单位的5种不同的市售UNGs进行PCR。PCR后,将PCR产物在室温下孵育各种时间间隔,然后加热并随后冷却。PCR产物的凝胶电泳显示UNG重新活化,因此,除了Cod UNG外,所有测试的所有UNG的PCR产物都严重降解。

图2.用1 U Cod UNG(A)或1 U E.coli UNG(B)预处理并在室温下孵育3小时的测序PCR产物的色谱。只有Cod UNG保留序列质量不变。

通过对PCR产物进行测序,进一步评估了PCR后序列的质量和完整性。用添加到预混物中的四种不同的市售UNG之一进行PCR。PCR后,将PCR产物在室温或4°C下以不同的时间间隔孵育。随后将样品纯化并测序。*分析了序列数据,重点是由于UNG重新激活而降低了序列质量。如图2和图3所示,用UNG处理的样品,除用Cod UNG处理的样品外,由于UNG的再活化而显示出严重的PCR产物降解。

0h6h24hControlCod UNGSupplier ASupplier BSupplier C0100200300400500600700800900Amplicon length (bp)

0小时6小时24小时
控制789779774
鳕鱼781785785
供应商A78478666
供应商B79248
供应商C801221

图3.UNG重新激活导致序列降解。经各种UNG预处理并在室温下孵育的PCR产物的序列数据。除与Cod UNG一起温育的样品外,所有样品均显示UNG的重新活化和PCR产物的严重降解。

聚合酶链反应

Cod UNG适用于所有市售的预混料。确保在先前的PCR实验中使用了包含dNTP混合物的dUTP。

  • 将0.25 U Cod UNG直接添加到25 µl PCR反应中
  • 在室温下预孵育5分钟
  • 运行PCR

在分析之前,将PCR产物在-20°C或4°C的温度下保存尽可能长的时间。

一站式RT-PCR

  • 将0.2 U Cod UNG直接添加到您的20 µl RT-PCR反应中
  • 在室温下预孵育5分钟
  • 在50- 55°C下逆转录您的RNA
  • 运行PCR

物产

Cod UNG适用于所有市售的预混料。确保在先前的PCR实验中使用了包含dNTP混合物的dUTP。

  • 将0.25 U Cod UNG直接添加到25 µl PCR反应中
  • 在室温下预孵育5分钟
  • 运行PCR

在分析之前,将PCR产物在-20°C或4°C的温度下保存尽可能长的时间。

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